Култивирането в разклащаща се колба е различно от повърхностното култивиране, при което клетките са директно изложени на високи концентрации на кислород. В културите в разклащаща се колба клетките са изложени на ниски концентрации на кислород, тъй като микроорганизмите са суспендирани в културалния бульон.